SMA Pangudi Luhur II Servasius adalah sekolah menengah tingkat atas yang didirikan oleh Yayasan Pangudi Luhur. Yayasan Pangudi Luhur merupakan Badan Pembantu Karya Kerasulan Kongregasi Para Bruder FIC dalam bidang kerasulan pendidikan. Badan ini sengaja didirikan oleh Kongregasi FIC dalam bidang implementasi dari semangat pendiri Kongregasi FIC yang mempunyai kharisma dalam bidang pendidikan untuk mendampingi kaum muda secara utuh dan optimal. Kongregasi FIC didirikan oleh Mgr. L. Rutten, pada tahun 1840 pusatnya di Maastricht, Netherland. Karya FIC seluruh dunia meliputi : Netherland (Eropa), Chili (Amerika Latin), Malawi (Afrika), Ghana (Afrika), dan Indonesia (Asia).
Karya kerasulan kongregasi FIC di Indonesia dalam bidang pendidikan operasionalnya ditangani oleh Yayasan Pangudi Luhur. Yayasan ini menangani pendidikan pada jenjang Taman Kanak – Kanak, Pendidikan Dasar, dan Pendidikan Menengah. Operasional kerja praktis keseharian Yayasan Pangudi Luhur dibantu oleh Yayasan Pangudi Luhur Cabang yang meliputi : Cabang Semarang, Surakarta, Yogyakarta, Kedu, Ketapang (Kalimantan Barat), Sumatera Selatan, Sorong (Irian Jaya) dan Jakarta.
SMA Pangudi Luhur II Servasius merupakan bawahan langsung dari Yayasan Pangudi Luhur Cabang Jakarta. Sekolah ini didirikan menanggapi : Pertama permintaan dari Pastur Paroki Kampung Sawah Rm. Kurris SJ. Beliau mengharapkan kehadiran sekolah tingkat SMA di Paroki Kampung Sawah, sebagai wahana pendukung pewartaan iman, pembinaan, dan pendampingan kaum muda. Kedua, kebutuhan masyarakat Kampung Sawah dan sekitarnya dalam bidang pendidikan, mengingat sekolah tingkat SMA masih sangat sedikit ditambah jarak tempuh sangat jauh. Banyak perumahan yang dibangun di sekitar Kampung Sawah, tentu mereka mengharapkan kehadiran sekolah terdekatyang lebih mudah dijangkau. Situasi ini mengetuk Yayasan Pangudi Luhur untuk mengulurkan tangan memberikan sumbangan dalam bentuk pendirian sekolah SMA Pangudi Luhur II Servasius. Dengan berdirinya sekolah diharapkan masyarakat Kampung Sawah dan sekitarnya dapat menikmati pendidikan yang berkualitas, dengan fasilitas yang memadahi dan terbuka bagi siapa saja.
Sekolah ini mulai membuka pendaftaran siswa baru pada tanggal 14 April 1999, dengan tempat masih menumpang di SLTP Strada Kampung Sawah. Tanggal 19 Juli 1999 sekolah berdiri dengan ditandai masuknya siswa – siswi yang pertama kali sebanyak 105 murid, terdiri dari 64 putra dan 41 putri. Selama tahun pelajaran 1999 – 2000 SMA PL II Servasius melaksanakan PBM pada sore hari mulai dari pukul 13.00 s/d 17.55, sementara pembangunan gedung baru dan tidak menumpang lagi di SLTP Strada Kampung Sawah.